MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC6

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017070	AAG	2	6	1263	1268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017070	AAT	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017070	ATT	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017070	TA	4	8	1359	1366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017070	TAGTAA	2	12	1394	1405	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017070	TAGA	2	8	1426	1433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017070	TTA	2	6	2507	2512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017070	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017070	TAA	2	6	2542	2547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017070	TTTTA	2	10	2549	2558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017070	TA	3	6	2586	2591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017070	AT	3	6	3243	3248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017070	AAC	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017070	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017070	T	6	6	3307	3312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017070	TA	3	6	4566	4571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017070	TA	3	6	4575	4580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017070	TAT	2	6	4595	4600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017070	CCT	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017070	A	7	7	6325	6331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017070	AT	3	6	6350	6355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017070	TGT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017070	TAT	2	6	6368	6373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017070	AAC	2	6	6376	6381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017070	AT	3	6	6389	6394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017070	AATG	2	8	8234	8241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017070	TAC	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017070	TCA	2	6	8304	8309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017070	AATA	2	8	8318	8325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017070	CAAT	2	8	8343	8350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017070	GTT	2	6	8380	8385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017070	CCCT	2	8	8395	8402	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017070	T	7	7	8438	8444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017070	GT	3	6	8445	8450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017070	GCC	2	6	8506	8511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017070	ATG	2	6	8614	8619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017070	TTCT	2	8	10907	10914	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017070	GGT	2	6	10938	10943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017070	A	6	6	11039	11044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017070	A	6	6	14486	14491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017070	ACT	2	6	14655	14660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017070	TTCGC	2	10	14711	14720	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017070	GAG	2	6	14742	14747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017070	A	7	7	16995	17001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017070	TCC	2	6	18578	18583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017070	AGTA	2	8	18584	18591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017070	TACT	2	8	18603	18610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017070	GGA	2	6	18611	18616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017070	TAT	2	6	18625	18630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017070	TTC	2	6	19516	19521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017070	AAAAT	2	10	19563	19572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017070	ACA	2	6	19588	19593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017070	TCT	2	6	19594	19599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017070	AGA	2	6	19700	19705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017070	A	6	6	19719	19724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017070	TAT	2	6	19809	19814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017070	TTC	2	6	19881	19886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017070	TAC	2	6	21949	21954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017070	CA	3	6	21978	21983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017070	C	6	6	22174	22179	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_017070	ATA	2	6	22201	22206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017070	AT	3	6	22236	22241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017070	TAT	2	6	22270	22275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017070	G	6	6	22301	22306	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017070	TTGC	2	8	22384	22391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017070	A	6	6	22399	22404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017070	A	6	6	22433	22438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017070	CCTTC	2	10	22445	22454	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_017070	TTC	2	6	22523	22528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017070	ATTC	2	8	22552	22559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017070	GA	3	6	22560	22565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017070	TA	3	6	23326	23331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017070	AAT	2	6	23344	23349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017070	T	6	6	23391	23396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017070	AT	3	6	23441	23446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017070	CTC	2	6	23470	23475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017070	TTCT	2	8	23539	23546	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017070	CTTT	2	8	23547	23554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017070	CT	3	6	23555	23560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017070	GAAA	2	8	23569	23576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017070	AAG	2	6	23676	23681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017070	GAG	2	6	23682	23687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017070	TAG	2	6	25275	25280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017070	TGT	2	6	25288	25293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017070	T	6	6	25296	25301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017070	C	7	7	25324	25330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_017070	ATT	2	6	25375	25380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017070	GGT	2	6	25398	25403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017070	AGC	2	6	26072	26077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017070	GAAAAG	2	12	26109	26120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017070	GAG	2	6	26146	26151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017070	CAT	2	6	26522	26527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017070	AT	3	6	26526	26531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017070	TTA	2	6	26532	26537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017070	AGG	2	6	26555	26560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017070	A	6	6	26880	26885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017070	ATTA	2	8	26943	26950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017070	AT	3	6	26993	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017070	GACC	2	8	26999	27006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017070	GTAT	2	8	28266	28273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017070	TAA	2	6	28288	28293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017070	A	6	6	28556	28561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017070	TTG	2	6	28578	28583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017070	TAA	2	6	29084	29089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017070	AT	3	6	29102	29107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017070	ATT	4	12	29113	29124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017070	TAA	3	9	29126	29134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017070	TA	3	6	29202	29207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017070	TAT	2	6	29224	29229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017070	ATTT	2	8	29255	29262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017070	AT	3	6	29270	29275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017070	TA	3	6	29802	29807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017070	TAAT	2	8	29809	29816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.